高电场强度电泳时,除了降低核酸样品的热效应,还需要注意以下问题:
防止凝胶破裂:高电场强度下,凝胶内部会产生较大的应力,容易导致凝胶破裂。因此,要确保凝胶的制备质量,凝胶浓度均匀、凝固充分;同时,在电泳过程中要避免电泳槽受到震动或碰撞。
避免电极腐蚀:高电场强度可能会加速电极的腐蚀,尤其是在长时间电泳或使用高离子强度缓冲液时。应选择质量好、耐腐蚀的电极,如铂电极;定期检查电极的状况,如有腐蚀及时更换;并且在电泳结束后,及时清洗电极,去除表面的电解质和杂质。
注意安全:高电场强度电泳使用的电压较高,存在触电风险。操作时要确保电泳设备接地良好,使用绝缘手套和护目镜等防护装备;在电泳过程中,不要触摸电泳槽和电极,避免发生触电事故。
考虑核酸分子的构象变化:高电场强度可能会使核酸分子的构象发生变化,从而影响其迁移行为。对于一些特殊结构的核酸分子,如超螺旋 DNA 或具有复杂二级结构的 RNA,可能需要在缓冲液中加入适量的辅助试剂,如尿素、甲酰胺等,以帮助维持核酸分子的天然构象,保证电泳结果的准确性。
防止样品扩散:高电场强度下,样品在凝胶中的扩散速度可能会加快,导致条带变宽,分辨率下降。可通过在样品中加入适量的蔗糖或甘油等密度试剂,增加样品的密度,减少扩散;同时,尽量缩短电泳时间,也有助于降低样品的扩散程度。
准确选择 Marker:由于高电场强度下核酸分子的迁移速度可能与常规条件不同,需要选择合适的分子量 Marker 作为参照。最好选择在高电场强度下迁移行为稳定、条带清晰的 Marker,以便准确判断核酸分子的大小和迁移情况。
确保设备稳定:电泳设备的稳定性对高电场强度电泳至关重要。使用前要检查设备的电源、电极连接等是否正常,避免在电泳过程中出现电压波动或设备故障,影响实验结果。